Su'ega DNA methylation tu'ufa'atasia ma telefonipoto mo su'esu'ega vave o tuma ma su'esu'ega leukemia ma le sa'o o le 90.0%!

O le vave su'esu'eina o le kanesa e fa'atatau i le su'esu'eina o le vai o se itu fou o le su'esu'eina o le kanesa ma su'esu'ega na fa'atulaga e le US National Cancer Institute i tausaga talu ai, ma le fa'amoemoe e vave iloa ai le kanesa po'o ni manu'a muamua. Ua fa'aaogaina lautele e fai ma fa'ailoga fou mo le vave su'esu'eina o fa'ama'i ma'i eseese, e aofia ai le kanesa o le mama, tumo o le manava, gliomas ma le ma'i gynecological.

O le tula'i mai o fa'avae e fa'ailoa ai fa'ailoga o le methylation landscape (Methylscape) o lo'o iai le malosi e fa'aleleia atili ai le su'esu'ega muamua o le kanesa, ma tu'u ai tagata mama'i i le taimi muamua e mafai ai ona togafitia.

Talu ai nei, na fausia ai e le au suʻesuʻe se faʻataʻitaʻiga faigofie ma tuusaʻo mo le suʻesuʻeina o laufanua methylation e faʻavae i luga o nanoparticles auro teuteu cysteamine (Cyst/AuNPs) faʻatasi ma se biosensor e faʻaogaina telefonipoto e mafai ai ona vave suʻesuʻeina le tele o tumo. E mafai ona faia le su'esu'ega vave mo le lukimia i totonu ole 15 minute pe a uma ona aveese mai le DNA mai se fa'ata'ita'iga toto, ma le sa'o o le 90.0%. Ole ulutala ole su'esu'ega vave ole DNA ole kanesa ile toto o le tagata e fa'aaoga ai le AuNPs e fa'apipi'i cysteamine ma se masini atamai e mafai ona a'oa'oina.

Ata 1. E mafai ona fa'ataunu'uina i ni la'asaga faigofie se lua se fa'ailoga faigofie ma vave mo le su'eina o le kanesa e ala i vaega o le Cyst/AuNPs.

O loʻo faʻaalia i le Ata 1. Muamua, o se vaifofo vai na faʻaaogaina e faʻaumatia ai vaega o le DNA. Ona faʻaopoopoina lea o Cyst / AuNPs i le fofo fefiloi. O le DNA masani ma le leaga o loʻo i ai uiga eseese o le methylation, e mafua ai ni vaega o le DNA ma ni mamanu faʻapipiʻi eseese. O le DNA masani e faʻapipiʻi faʻatasi ma mulimuli ane faʻapipiʻi Cyst / AuNPs, lea e mafua ai le lanu mumu-siitia o Cyst / AuNPs, ina ia mafai ona matauina se suiga i le lanu mai le mumu i le lanu viole i le mata le lava. I se faʻatusatusaga, o le faʻailoga tulaga ese o le methylation o le kanesa DNA e taʻitaʻia ai le gaosiga o fuifui tetele o vaega DNA.

O ata o 96-well plates na pu'eina e fa'aoga ai se mea pu'eata atamai. O le kanesa DNA na fuaina e se telefoni fa'apipi'iina i masini a'oa'oga fa'atusatusa i metotia fa'atatau ile spectroscopy.

Su'esu'ega o le kanesa i fa'ata'ita'iga toto moni

Ina ia faʻalauteleina le aoga o le tulaga faʻalogo, na faʻaogaina e le au suʻesuʻe se masini e iloagofie ai le va o le DNA masani ma le kanesa i faʻataʻitaʻiga toto moni. fa'asologa o le methylation i nofoaga CpG e fa'atulafonoina le fa'aaliga o kenera. I le toetoe lava o ituaiga uma o le kanesa, o suiga i le DNA methylation ma faʻapea i le faʻaalia o kenera e faʻamalosia ai le tumourigenesis ua matauina e fesuiaʻi.

I le avea ai o se faʻataʻitaʻiga mo isi kanesa e fesoʻotaʻi ma le DNA methylation, na faʻaogaina e le au suʻesuʻe toto faʻataʻitaʻiga mai tagata maʻi leukemia ma faʻatonuga soifua maloloina e suʻesuʻe ai le aoga o le laufanua methylation i le faʻavasegaina o kanesa leukaemic. O lenei methylation landscape biomarker e le gata e sili atu i luga o metotia suʻesuʻe vave o le leukemia, ae faʻaalia ai foi le mafai ona faʻalautele i le vave iloa o le tele o kanesa e faʻaaoga ai lenei suʻega faigofie ma tuusaʻo.

DNA mai fa'ata'ita'iga toto mai le 31 leukimia ma le 12 tagata soifua maloloina sa su'esu'eina. e pei ona faʻaalia i le pusa pusa i le Ata 2a, o le suʻesuʻeina o faʻataʻitaʻiga o le kanesa (ΔA650 / 525) na maualalo ifo nai lo le DNA mai faʻataʻitaʻiga masani. O lenei mea na mafua ona o le faʻaleleia o le hydrophobicity e taʻitaʻia ai le mafiafia o le DNA o le kanesa, lea na taofia ai le faʻapipiʻiina o Cyst / AuNPs. O le iʻuga, o nei nanoparticles na faʻasalalau atoa i totonu o le pito i fafo o le kanesa aggregates, lea na iʻu ai i se faʻasalalauga eseʻese o Cyst / AuNPs faʻapipiʻi i luga ole masani ma kanesa DNA aggregates. O pupuni ROC na faʻatupuina e ala i le fesuiaʻiina o le faitotoʻa mai le tau maualalo ole ΔA650 / 525 i se tau maualuga.

Ata 2.(a) Fa'atatau ole su'esu'e o vaifofo o le cyst/AuNPs o lo'o fa'aalia ai le iai ole DNA masani (lanumoana) ma le kanesa (mumu) i lalo ole tulaga lelei.

(DA650/525) o pusa pusa; (b) su'esu'ega ole ROC ma su'esu'ega ole su'esu'ega. (i) Fa'ailoga fenumia'i mo su'esu'ega o gasegase masani ma le kanesa. (d) Ma'ale'ale, fa'apitoa, tau fa'atatau lelei (PPV), tau fa'ailoga leaga (NPV) ma le sa'o o le auala na atia'e.

E pei ona faʻaalia i le Ata 2b, o le vaega i lalo ole ROC curve (AUC = 0.9274) na maua mo le atinaʻeina o le masini na faʻaalia ai le maualuga ma le faʻapitoa. E pei ona mafai ona vaʻaia mai le pusa pusa, o le pito pito i lalo e fai ma sui o le DNA masani e leʻo vavaeeseina lelei mai le pito sili ona maualuga e fai ma sui o le DNA o le kanesa; o le mea lea, na faʻaaogaina ai le faʻaogaina o le logistic e faʻaeseese ai le va o vaega masani ma le kanesa. A tu'uina atu i se seti o fesuiaiga tuto'atasi, e fa'atatauina le avanoa o se mea e tupu, e pei o se kanesa po'o se vaega masani. Ole fua fa'alagolago e va'aia ile va ole 0 ma le 1. O lea la o le i'uga o se avanoa. Na matou fuafuaina le avanoa e iloagofie ai le kanesa (P) faʻavae ile ΔA650/525 e pei ona taua i lalo.

lea b=5.3533,w1=-6.965. Mo le fa'avasegaga o fa'ata'ita'iga, o se avanoa e itiiti ifo i le 0.5 e fa'ailoa mai ai se fa'ata'ita'iga masani, ae o se fa'ata'ita'iga o le 0.5 pe maualuga atu e fa'ailoa mai ai se fa'ata'ita'iga o le kanesa. O le ata 2c o loʻo faʻaalia ai le matrix fenumiai na maua mai i le tuʻuina-i-naʻo le faʻamaonia-faʻamaonia, lea na faʻaaogaina e faʻamaonia ai le mautu o le faʻavasegaina o auala. Ata 2d o lo'o aoteleina ai le su'esu'ega o su'esu'ega fa'ata'ita'iga o le metotia, e aofia ai le ma'ale'ale, fa'apitoa, tau fa'atatau lelei (PPV) ma tau fa'ailoga leaga (NPV).

Biosensors fa'avae telefonipoto

Ina ia faʻafaigofie atili suʻega faʻataʻitaʻiga e aunoa ma le faʻaogaina o spectrophotometers, na faʻaogaina e le au suʻesuʻe le atamai faʻapitoa (AI) e faʻamatala ai le lanu o le fofo ma iloa ai le va o tagata masani ma tagata gasegase. Ona o lenei mea, na faʻaaogaina ai le vaʻaiga komepiuta e faʻaliliu ai le lanu o le Cyst / AuNPs solution i le DNA masani (lanu viole) poʻo le kanesa DNA (mumu) e faʻaaoga ai ata o 96-well plates na puʻeina i se telefoni feaveaʻi. O le atamai fa'apitoa e mafai ona fa'aititia ai tau ma fa'aleleia atili le avanoa i le fa'amatalaina o le lanu o vaifofo nanoparticle, ma e aunoa ma le fa'aogaina o so'o se mea fa'aoga telefoni feavea'i. Mulimuli ane, e lua faʻataʻitaʻiga aʻoaʻoga masini, e aofia ai Random Forest (RF) ma Support Vector Machine (SVM) na aʻoaʻoina e fau faʻataʻitaʻiga. o faʻataʻitaʻiga RF ma SVM saʻo faʻavasegaina faʻataʻitaʻiga e lelei ma le lelei ma le saʻo o le 90.0%. O loʻo faʻaalia ai o le faʻaogaina o le atamai faʻapitoa i le biosensing faʻavae telefoni feaveaʻi e mafai lava.

Ata 3.(a) Vasega fa'atatau o le vaifofo na fa'amaumauina i le taimi o tapenaga o le fa'ata'ita'iga mo le la'asaga o le mauaina o ata. (b) Fa'ata'ita'iga ata na pu'eina ile la'asaga ole mauaina o ata. (c) Le malosi o le lanu o le kiona / AuNPs solution i vaieli taitasi o le 96-well plate na aumai mai le ata (b).

I le fa'aaogaina o le Cyst/AuNPs, ua manuia ai le au su'esu'e i le atina'eina o se fa'ata'ita'iga faigofie mo le su'esu'eina o laufanua o le methylation ma se masini e mafai ai ona iloa le eseesega o le DNA masani mai le DNA o le kanesa pe'a fa'aaoga toto moni mo su'esu'ega leukemia. O le masini fa'atupuina na fa'aalia ai o le DNA na maua mai fa'ata'ita'iga moni o le toto na mafai ona vave ma taugofie le su'esu'eina o ni vaega laiti o le kanesa DNA (3nM) i tagata mama'i leukemia i le 15 minute, ma fa'aalia ai le sa'o o le 95.3%. Ina ia faʻafaigofie atili faʻataʻitaʻiga faʻataʻitaʻiga e ala i le faʻaumatiaina o le manaʻomia o se spectrophotometer, na faʻaaogaina masini aʻoaʻoga e faʻamatala ai le lanu o le vaifofo ma faʻaeseese i le va o tagata masani ma tagata gasegase e faʻaaogaina se ata telefoni feaveaʻi, ma sa mafai foi ona ausia le saʻo i le 90.0%.

Fa'amatalaga: DOI: 10.1039/d2ra05725e