Na urod | O le tele-omics auala i le faaitiitia o le tuufaatasiga tulgod

Na urod | O le tele-omics auala i le faʻatatauina o le tulgatting tumur, puipuia ma microbial laufanua o le kanesa o le lalolagi faʻaalia le fegalegaleaiga o le microbiome ma le puipuiga o le microbiome
E ui o Biomamoryers mo Court Couny na suʻesuʻe tele i tausaga talu ai, o loʻo i ai nei taʻiala o loʻo i luga o le o loʻo i ai i le DNA. ) e fuafua i le togafitiga togafitiga. Na matauina e tagata suʻesuʻe le leai o se soʻotaga i le va o le Genera fua o tali mai o tali, Microbal Debory Comore Comort Comort Comort Comort Comort Comort Com

A o alualu i luma suʻesuʻega, aofaʻi o uiga o le Koneporation Court Casest, e aofia ai ma le kanesa cellolar, puipuia, stronable agavaʻa o taunuʻuga o le kanesa. .
Le lafoaʻi o le fesoʻotaʻiga i le va o le Phnotypic svenmpity, o le 'au o tagata suʻesuʻe mai le SIDRA Institute o fomaʻi o tagata mamaʻi e ala i le tuʻufaʻatasia taofi (ICR). O le 'au na faia se auiliiliga o le auiliiliga o mea fou o le frozen o faʻataʻitaʻiga mai 348 tagata maʻi ma le muamua o le kanera, e aofia ai le gectal connal o lotonuu o le mayomen requening e uiga atili ai i le microbiome. O le suʻesuʻega na lolomiina i le natura vailaau o se "tuʻufaʻatasia pamu, puipuia ma microbiome ila o le kanesa kanesa".

Na lolomiina le tusitusiga i le natura vailaau

AC-ICAM aotelega

O tagata suʻesuʻe na faʻaaogaina se Orthogonil Cloomic Statusform e aʻoaʻo ai le New Frozen Frood Froor Speor Sworts o faʻataʻitaʻiga o le Courn Cournis e aunoa ma se ata o le Cournad. Faʻavae i luga o le atoa-exame sequening (wes), rna-seq faʻamatalaga faʻamatalaga lelei, ma o le aofia ai faʻamatalaga faʻalauiloa mai 348 tagata gasegase na sailia ma le mediam e oʻo atu i le 4.6 tausaga ua toe amataina ile 4.6 tausaga. O le vaega o suʻesuʻega e igoa i lenei punaoa o le Sidira-Lumc Ac-ICAM: O se faʻafanua ma taʻiala e puipuia ai le puipuia o le Discune-Sciobiome.

Molecular faʻavasegaina faʻaaoga le ICR

O le puʻeina o se modular seti o le tino faʻalenatura faʻailoga mo le faʻaauau pea o le kanesa o loʻo faʻaaogaina le kanesa o le susu. ICR sa i ai foi ma le itu i le itu i le mamafa o le kanesa o le kanesa o ituaiga kanesa, e aofia ai le susu susu.

Muamua, o tagata suʻesuʻe e faʻamaonia ai le ICR saini o le AC-ICAM Coart, faʻaaogaina le ICR General Boadters / Inter ICT) Tumme) (Ata 1B). O tagata suʻesuʻe na faʻailoa mai le uiga o le uafu e fesoʻotaʻi ma le auvae molecular iptypes (CMS), o se faʻasalalauga faʻavae o Kolisi o Kolone. O le CMS vaega e aofia ai CMS1 / puipuia, CMS2 / CMS2 / CMS3 / Metabolic ma CMS4 / Mesedymal. Iloiloga faaalia ai o ni tulafono tulafono sa ofi ma se tulafono i le kanesa o le kanesa i ituaiga o ituaiga uma CMDES, ma le mautinoa

I totonu o CMs uma, o le tele o le tai-natura (NK) Cell ma le Cell Nexts i le ICR i le ICR Crepacs (Ata 1C). I le ICR mai le maualalo i le maualuga (Ata 1D), e faʻamaonia ai le tulaga lelei o le ICR i le kanesa i le kanesa.

Ata 1. Ac-ICAAM Suesue mamanu, Internene-forbering genetage, vaitulagi genecular ma le molecular.
ICR puʻeina tulsor-faʻamalosi-faʻamalosiʻau, faʻaputuputu amplited t sela
Na o se tasi o le o le TLells Inllsper o le Intur Toursie na lipotia mai e patino mo le tumgor Annigens (lalo ifo o le 10%). O le mea lea, o le tele o intra-tem o sela o loʻo taʻua e pei o brastander t sela (bystander t sela). O le malosi sili ona malosi ma le numera o le masani masani t sela ma mea na matauina tcrs na maitauina i le stromal sela ma le matala o le conromal. I le ICR Clusters (aotelega ma le CMS Slassification), o le maualuga maualuga o le Inqunity Serqu TCRS sa maitauina i le ICR-maualuga ma le maualuga vaega o le ICR. Faʻaaogaina atoa le transcriptome (18,270 kenera), ono ICR Gene (ARN1, Irf1, CCL5, G_MA10) i totonu o le TLCR FORCAL (Ata 2). O le Sctunseq TCR Clonalty e le sili atu malosi ma tele o ICR Geor Genes nai lo le faʻasaʻoina na maitauina le faʻaaogaina o le TTMOR-tali (Ata 2f). I le faaiuga, o loʻo faʻaalia mai ai suʻesuʻega o lo o faʻaalia ai o saini ICR o loʻo puʻeina ai le afioaga-faʻamalosia, o loʻo faʻamatalaina ai ni sela a le lalolagi.

Ata 2. TCR metrics ma fesoʻotaʻi ma le fesoʻotaʻi ma le maimoaina o ituaiga, puipuia ma le laumei subtypes.
Microbiome tuufaatasiga i le soifua maloloina ma kolone kanesa
O tagata suʻesuʻe na faia 16s RRna sequation o loʻo faʻaaogaina le DNA e aveese mai le Tua Pimor ma Soifua Maloloina Countue mai le 246 Tagata gasegase (Ata 3A). Mo le faʻamaonia, o le suʻesuʻe faʻasaga i le 16s rrna RRNA o loʻo i ai faʻamatalaga mai se faʻaopoopoga 42 inmar faʻataʻitaʻiga e leʻi fetaui Muamua, o tagata suʻesuʻe na faʻatusa mai le tele o flora i le va o le au vaʻai ma le soifua maloloina o le komiti. Na matua faatelevaveina le au faamalo i le tulu i le tumeta na faatusatusa i le soifua maloloina o sini (ata 3a-3D). Sa leai se eseesega tele i le alpha eseese (eseese ma tele o ituaiga i se faʻataʻitaʻiga e tasi) i le va o aʻoga ma le soifua maloloina i le ICR-maualuga.
Ina ia iloa le faʻataʻitusiga talafeagai fesoʻotaʻiga i le va o le Microbial Produlit and Cornical Expers e faʻaaoga le 16s RRNA Gress e faʻailoa ai faʻamaumauga. I le AC-ICAM246, na faʻatautaia e tagata suʻesuʻe o le OS Cox Redression Previdy na filifilia 41 foliga mai o le le-leai-zero o le tino o le tino).
I totonu o lenei toleniga cothort (iCAM246), o le maualalo o le MBR togi (MBR <0, maualalo MBR) sa fesoʻotaʻi ma le sili maualalo lamatiaga o le oti (85%). Ua faʻamaonia e tagata suʻesuʻe le mafutaga i le va o le MBR (lamatiaga) ma le fuafuaina o OS i se lua tutoʻatasi faʻamaonia cothorts (ICAM42 ma TCGA-COD-COD (Ata 3) O le suʻesuʻega na faʻaalia ai se fesoʻotaʻiga malosi i le va o le QOOOGATATCATIC COCIS, o loʻo tutusa ma le le lelei ma le soifua maloloina o le komiti.

Ata 3. Microbiome i Toumor ma Soifua Maloloina Tieous ma le mafutaga ma le ICR ma le gasegase ola.
Faaiuga
O le tele-omics auala faʻaaogaina i totonu o lenei suʻesuʻega e mafai ai ona iloa lelei ma auiliiliga o le molecular saini o le tali mai le kanesa i le va o le microbaime ma le tino puipuia. O le loloto o le tcr sequent of Tumor ma Soifua Maloloina o loʻo faʻaalia ai o le alualu i luma o le ICR atonu e mafua mai i le puʻeina o le paʻu o loʻo i ai.

I le suʻesuʻeina o le Bumor Mimor Microbiome Consiction e faʻaaoga ai 16s RRNA Greing i Ac-ICAM faataʻitaʻi, o le 'au o loʻo faʻatagaina le aoga. E ui o lenei saini na maua mai i faʻataʻitaʻiga a le 'ai, sa i ai se fesoʻotaʻiga malosi i le va o le soifua maloloina Colored Colomple ma Tumr MROW Study, faʻailoa mai o lenei saini microbiome tufuga o tagata mamai. I le tuʻufaʻatasia o le ICR ma MBR togi, sa mafai ona e iloa ma faʻamaonia se tele o le omi-omi le bimarinak biomerker o loʻo vaʻaia i tagata o tagata gasegase. O le tele o le suʻesuʻega a le orti-octoset e maua ai se punaoa e sili atu le malamalama i le kanesa kanesa o le biology biology

Mau faasino:
Roelands, J., Kuppen, Pjk, Ahmed, Eit Al. O se tuufaatasiga tumu, puipuia ma microbiome Atlas o Colon kanesa. Nat 12 29, 1273-1286 (2023).