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Fa'atinoga o su'esu'ega fa'ateleina o le nucleic acid e iloa ai le SARS-CoV-2 i Etiopia

Faafetai mo le asiasi ile Nature.com.O lo'o e fa'aogaina se su'esu'ega e fa'atapula'aina le lagolago a le CSS.Mo le poto sili ona lelei, matou te fautuaina oe e te faʻaogaina se suʻesuʻega fou (pe faʻamalo le Faiga Faʻatasi i Internet Explorer).E le gata i lea, ina ia mautinoa le lagolago faifaipea, matou te faʻaalia le saite e aunoa ma sitaili ma JavaScript.
Fa'aali atu se carousel e tolu fa'asolo i le taimi e tasi.Fa'aoga fa'amau muamua ma le soso'o e fa'agasolo ai fa'ase'e se tolu i le taimi, pe fa'aoga fa'aa'a fa'asolo i le pito e fa'asolo ai fa'ase'e se tolu i le taimi.
Talu mai le 2019 coronavirus faʻamaʻi (COVID-19), o le tele o suʻesuʻega faʻamalosi faʻamalosi faʻamalosi faʻatau (NAATs) ua atiaʻe i le lalolagi atoa ma ua avea ma suʻega masani.E ui lava o le tele o suʻega na vave ona atiaʻe ma faʻaoga i suʻesuʻega faʻataʻitaʻi falesuesue, o le faʻatinoga o nei suʻega e leʻi iloiloina i ni tulaga eseese.O le mea lea, o lenei suʻesuʻega na faʻamoemoe e iloilo le faʻatinoga o le Abbott SARS-CoV-2, Daan Gene, BGI, ma le Sansure Biotech suʻega e faʻaaoga ai le Composite Reference Standard (CRS).O le suʻesuʻega na faia i le Ethiopian Public Health Institute (EPHI) mai le 1 i le 30 Tesema 2020. 164 faʻataʻitaʻiga nasopharyngeal na maua mai i le faʻaogaina o le QIAamp RNA mini kit ma le Abbott DNA sample preparation system.Mai 164 fa'ata'ita'iga, 59.1% sa lelei ma 40.9% sa le lelei mo CRS. Sansure Biotech positivity na matua maualalo pe a faatusatusa i le CRS (p <0.05). Sansure Biotech positivity na matua maualalo pe a faatusatusa i le CRS (p <0.05). Положительные результаты Sansure Biotech e mafai ona fa'aulu i luga ole laiga ile CRS (p <0,05). O taunu'uga lelei a le Sansure Biotech na matua'i maualalo pe a fa'atusatusa ile CRS (p <0.05).与CRS 相比，Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p <0.05）。与CRS 相比，Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p <0.05）。 У Sansure Biotech было значительно меньше положительных результатов по сравнению с CRS (p <0,05). O le Sansure Biotech e matua itiiti lava i'uga lelei pe a fa'atusatusa i le CRS (p <0.05).O le aotelega o le maliliega o iloiloga e fa o le 96.3-100% faʻatusatusa i le CRS.I le faaopoopo atu i le maualalo o le positivity rate o le Sansure Biotech assay, o le faʻatinoga o faʻataʻitaʻiga na toetoe a faʻatusatusa.E pei o lea, o le Sansure Biotech [Suʻesuʻega Naʻo (RUO)] suʻega e manaʻomia ai faʻamaoniga faaopoopo mo lona faʻaogaina i Etiopia.Ma le mea mulimuli, e tatau ona iloiloina su'esu'ega fa'aopoopo e iloilo ai su'ega fa'atasi ai ma fa'amatalaga talafeagai a le gaosiga.
Ole su'ega ole su'esu'ega ole vaega ole World Health Organization (WHO) Fuafuaga Fuafuaga mo le Fa'ama'i Coronavirus 2019 (COVID-19) Tapenaga ma Tali (SPRP).O loʻo fautuaina e le WHO e manaʻomia e atunuʻu le fausiaina o fale suʻesuʻe gafatia e faʻaleleia ai le sauniuni, faʻatautaia lelei mataupu, mataala ma vave tali atu i luʻitau o le soifua maloloina lautele.O lo'o fa'ailoa mai ai o le matafaioi a le falesu'esu'e o le ki lea e fa'ailoa ai le fa'ama'i ma le fa'ama'i o fa'ama'i pipisi ma fa'atonutonuina lo latou sosolo.
Ole su'esu'ega ole COVID-19 e mana'omia ai fa'amatalaga fa'ama'i ma fa'afoma'i, fa'ailoga patino/fa'ailoga, ma fa'amaumauga fa'a-leitio ma su'esu'ega2.Talu ona lipotia le faʻamaʻi COVID-19 i Wuhan, Saina, e tele suʻesuʻega faʻamalosi faʻamalosi faʻamalosi faʻatau (NAATs) ua fausia i le lalolagi atoa.O le taimi moni fa'aliliuga fa'aliliuga polymerase chain reaction (rRT-PCR) ua fa'aaogaina e fai ma auala masani ma masani mo su'esu'ega ile su'esu'ega ole fa'ama'i ogaoga manava manava 2 (SARS-CoV-2)3.Ole su'esu'ega mole ole SARS-CoV-2 e masani lava ona fa'avae ile N (nucleocapsid protein gene), E (envelope protein gene), ma RdRp (RNA-dependent RNA polymerase genes) i le ORF1a/b (tatala faitau fa'avaa 1a/b) .gene) itulagi ua iloa mai le genome viral.O lo'o fa'apea o nofoaga fa'asao fa'apolopolo o lo'o maua i genom viral mo le fa'ailoaina ole virus4.Faatasi ai ma nei kenera, o kenera RdRp ma E e maualuga le maaleale o su'esu'ega, ae o le gene N e maualalo le maaleale5.
O le fa'atinoga o su'ega PCR e ono fesuisuia'i e fa'atatau i mea eseese e pei o: reagents extraction, amplification/detection reagents, auala fa'aala, lelei ole masini PCR ma isi mea faigaluega.E oʻo mai ia Aperila 2020, e silia ma le 48 masini suʻesuʻe eseese mai atunuʻu e iva ua maua le Faʻatagaina o Faʻalavelave Faʻafuaseʻi (EUA) mo faʻamaʻi COVID-196.I Etiopia, e sili atu i le 14 taimi moni PCR platforms o loʻo faʻaogaina mo le PCR suʻesuʻeina o le SARS-CoV-2 i le 26 faʻalapotopotoga faʻalesoifua maloloina lautele, e aofia ai le ABI 7500, Abbott m2000, Roche 48000 ma Quant-studio7.E le gata i lea, o loʻo maua ni pusa suʻega PCR eseese, e pei o le Daan Gene suʻega, Abbott SARS-CoV-2 suʻega, Sansure Biotech suʻega, ma le SARS-CoV-2 BGI suʻega.E ui ina matua maaleale le rRT-PCR, ae o nisi o gasegase e maua i le COVID-19 e lipotia iʻuga leaga sese ona o le le lava o kopi o viral ribonucleic acid (RNA) i faʻataʻitaʻiga ona o le le lelei o le aoina, felauaiga, teuina ma le taulimaina, ma suʻega suʻesuʻe.tulaga ma gaioiga a tagata faigaluega8.E le gata i lea, fa'ata'ita'iga po'o le fa'atonutonuina o le fa'aogaina sese, ta'amilosaga ta'amilosaga (Ct) fa'atulagaina, ma feso'ota'iga fa'atasi ma isi pathogenic nucleic acids po'o le SARS-CoV-2 RNA ua le toaga/toega e mafai ona ta'ita'iina i'uga lelei sese ile su'ega rRT-PCR9.O le mea lea, e manino lava o suʻega PCR e mafai moni lava ona faʻailoaina o loʻo feaveaʻi vaega o kenera, aua e le mafai ona latou iloa le va o genes faʻamalosi moni, o lea e mafai ai e suʻega ona iloa naʻo tagata feaveaʻi ae le o gasegase10.O le mea lea, e taua le suʻesuʻeina o faʻataʻitaʻiga faʻataʻitaʻiga e faʻaaoga ai metotia masani i la tatou faʻatulagaga.E ui lava o loʻo maua le tele ole NAAT reagents ile Ethiopian Public Health Institute (EPHI) ma le atunuʻu atoa, e leai se iloiloga faʻatusatusa o lo latou aoga ua lipotia mai.O le mea lea, o lenei suʻesuʻega na faʻamoemoe e iloilo le faʻatusatusaga o faʻatinoga o pusa faʻatau oloa mo le suʻeina o le SARS-CoV-2 e le rRT-PCR e faʻaaoga ai faʻataʻitaʻiga faʻapitoa.
E tusa ma le 164 tagata auai ma masalomia COVID-19 na aofia i lenei suʻesuʻega.O le tele o faʻataʻitaʻiga e mai i nofoaga autu o togafitiga (118/164 = 72%), ae o le 46 (28%) o totoe na auai mai nofoaga e le o togafitiga.I totonu o tagata auai e leʻi togafitia i le ogatotonu, 15 (9.1%) na masalomia faʻamaʻi ma 31 (18.9%) na i ai fesoʻotaʻiga o mataupu faʻamaonia.E ivasefulu-tolu (56.7%) na auai o tane, ma o le fua (± SD) tausaga o tagata auai o 31.10 (± 11.82) tausaga.
I lenei suʻesuʻega, na faʻamauina ai fua faatatau lelei ma leaga o suʻega e fa mo le COVID-19.O lea la, o fua faatatau lelei o le Abbott SARS-CoV-2 suʻega, Daan Gene 2019-nCoV suʻega, SARS-CoV-2 BGI suʻega, ma le Sansure Biotech 2019-nCoV suʻega e 59.1%, 58.5%, 57.9% ma le 55.5% i le faasologa. .O le lelei ma le le lelei o fa'amaumauga tu'ufa'atasi (CRS) togi e 97 (59.1%) ma le 67 (40.9%), fa'asologa (Laulau 1).I lenei su'esu'ega, o le fa'auigaina o le CRS na fa'avae i luga o le tulafono "so'o se mea lelei", lea mai fa'ai'uga o su'ega, lua pe sili atu fa'ai'uga o su'ega na maua ai le fa'ai'uga tutusa e manatu lelei moni pe leaga.
I lenei suʻesuʻega, na matou maua ai se maliega pasene le lelei (NPA) o le 100% (95% CI 94.6-100) mo suʻesuʻega uma faʻatusatusa i le CRS.O le suʻesuʻega a le Sansure Biotechnology na faʻaalia ai le laʻititi o le PPA o le 93.8% (95% CI 87.2-97.1) ma le Daan Gene 2019-nCoV faʻataʻitaʻiga o loʻo iai le maliega atoa e 99.4% (95% CI 96.6-99.9).I se faʻatusatusaga, o le maliliega lautele i le va o le SARS-CoV-2 BGI suʻega ma le Sansure Biotech 2019-nCoV suʻega e 98.8% ma le 96.3%, i le faasologa (Laulau 2).
Cohen's kappa coefficient o maliliega i le va o le CRS ma Abbott SARS-CoV-2 suʻesuʻega sa atoatoa atoatoa (K = 1.00).E faʻapea foʻi, o faʻatauga a Cohen's kappa na maua e Daan Gene 2019-nCoV, SARS-CoV-2 BGI, ma le Sansure Biotech 2019-nCoV o loʻo ogatasi atoa ma CRS (K ≥ 0.925).I lenei su'esu'ega fa'atusatusa, o le su'ega chi-square (su'ega McNemar) na fa'aalia ai o fa'ai'uga o su'esu'ega a le Sansure Biotech 2019-nCoV e matua'i ese lava mai fa'ai'uga CRS (p = 0.031) (Laulau 2).
E pei ona faaalia i le Ata.1 o le pasene o le tau maualalo Ct (<20 Ct) o le Abbott SARS-CoV-2 suʻega (tuʻufaʻatasi RdRp ma N gene) e 87.6% ma le ORF1a/b gene Ct tau o le Sansure Biotech 2019-nCoV suʻega na faʻaalia ai le pasene o le maualalo. Ct tau (<20 Ct) o le 50.3% ma le maualuga Ct tau (36-40 Ct) o le 3.2%. 1 o le pasene o le tau maualalo Ct (<20 Ct) o le Abbott SARS-CoV-2 suʻega (tuʻufaʻatasi RdRp ma N gene) e 87.6% ma le ORF1a/b gene Ct tau o le Sansure Biotech 2019-nCoV suʻega na faʻaalia ai le pasene o le maualalo. Ct tau (<20 Ct) o le 50.3% ma le maualuga Ct tau (36-40 Ct) o le 3.2%.E pei ona faaalia i le Ata.1, процент наименьшего значения Ct (< 20 Ct) анализа Abbott SARS-CoV-2 (комбинированный ген RdRp и N) составил 87,6%, а значение Ct гена ORF1a/b анализа Sansure Biotech 2019-nCoV показало что процент низкого значения Ct (< 20 Ct) составлял 50,3%, а высокое значение Ct (36–40 Ct) составляло 3,2%. 1, o le pasene o le tau maualalo Ct tau (<20 Ct) suʻesuʻega o Abbott SARS-CoV-2 (gane tuʻufaʻatasi RdRp ma N) sa 87.6%, ma le Ct tau o le ORF1a/b suʻesuʻega gene o le Sansure Biotech 2019-nCoV na faʻaalia. o le pasene o le tau maualalo Ct (<20 Ct) na maua ai le 50.3%, ma le maualuga o le Ct (36-40 Ct) e 3.2%.如图1 所示，Abbott SARS-CoV-2 检测（结合RdRp 和N 基因）的最低Ct 值百分比（< 20 Ct）为87.6%，Sansure Biotech 2019-nCoV 检测的ORF1a/b 基因Ct 值显示低Ct值(< 20 Ct) 的百分比为50.3%，高Ct 。(36–40 Ct) 的百分比为 3.2%. E pei ona fa'aalia i le Ata 1, o le pasene aupito maualalo o le tau o le Ct (<20 Ct) o le su'ega a Abbott SARS-CoV-2 (tu'ufa'atasi o le kenera RdRp ma le N) e 87.6%, o le tau o le ORF1a/b gene Ct o le su'ega a le Sansure Biotech 2019-nCoV. o lo'o fa'aalia ai le maualalo o le Ct(<20 Ct) o le pasene e 50.3%, o le 高Ct(36–40 Ct) o le pasene e 3.2%. Как показано на рисунке 1, анализ Abbott SARS-CoV-2 (сочетающий гены RdRp и N) имел самое низкое процентное значение Ct (< 20 Ct) в размере 87,6%, а значение Ct гена ORF1a/b в исследовании Sansure Biotech 2019 - Анализ nCoV показал низкий Ct. E pei ona faʻaalia i le Ata 1, o le suʻega a Abbott SARS-CoV-2 (tuʻufaʻatasia le RdRp ma le N genes) e maualalo le pasene Ct tau (<20 Ct) i le 87.6%, ae o le Ct tau o le ORF1a/b gene i le Sansure. Biotech 2019 suʻesuʻega - O le auiliiliga o le nCoV na faʻaalia ai le maualalo o Ct. Процент значений (< 20 Ct) составил 50,3%, а процент высоких значений Ct (36–40 Ct) составил 3,2%. O le pasene o tau (<20 Ct) o le 50.3%, ma le pasene o maualuga Ct tau (36-40 Ct) o le 3.2%.O le suʻega a Abbott SARS-CoV-2 B na faʻamauina Ct tau i luga atu o le 30. I le isi itu, i luga o le BGI SARS-CoV-2 suʻesuʻega ORF1a/b gene sa i ai le maualuga Ct tau (> 36 Ct) pasene e 4% (Fig. 1). I le isi itu, i luga o le BGI SARS-CoV-2 suʻesuʻega ORF1a/b gene sa i ai le maualuga Ct tau (> 36 Ct) pasene e 4% (Fig. 1). С другой стороны, в анализе BGI SARS-CoV-2 ген ORF1a/b имел высокое значение Ct (> 36 Ct), процент которого составл. 1%). I le isi itu, i le auiliiliga o le BGI SARS-CoV-2 gene ORF1a/b sa maualuga Ct tau (> 36 Ct), o le pasene o le 4% (Fig. 1).另一方面，在BGI SARS-CoV-2 检测中，ORF1a/b 基因具有高Ct 伈> 36 Ct）的百分比为4%（图。 I le isi itu, i le BGI SARS-CoV-2 suʻesuʻega, o le pasene o le ORF1a/b gene ma maualuga Ct tau (>36 Ct) e 4% (Ata 1). С другой стороны, в анализе BGI SARS-CoV-2 процент генов ORF1a/b с высокими значениями Ct (>36 Ct) составил 4% (aso. 1). I le isi itu, i le BGI SARS-CoV-2 suʻesuʻega, o le pasene o kenera ORF1a/b e maualuga Ct tau (>36 Ct) e 4% (Fig. 1).
I lenei suʻesuʻega, na matou aveina 164 faʻataʻitaʻiga nasopharyngeal.Mo ituaiga uma o suʻega, RNA tuʻuesea ma faʻalauteleina na faʻatinoina e faʻaaoga ai metotia ma pusa na fautuaina e le au gaosi taʻitasi.
O lenei suʻesuʻega na faʻaalia ai o le suʻega a Abbott mo le SARS-CoV-2 o loʻo i ai le faʻatinoga tutusa ma le CRS, faʻatasi ai ma le 100% lelei, leaga, ma le faʻasologa atoa.O le maliega kappa a Cohen e 1.00, e faʻaalia ai le maliliega atoatoa ma le CRS.O se suʻesuʻega tutusa a le Iunivesite o Uosigitone i le US na maua ai o le aotelega o le maʻaleʻale ma le faʻapitoa o le suʻega a Abbott mo le SARS-CoV-2 e 93% ma le 100%, faʻatusatusa i le suʻesuʻega faʻataʻitaʻi (LDA) a le CDC. .11. O le Abbott SARS-CoV-2 detection system e fa'avae i luga ole su'esu'ega tu'ufa'atasi o le N ma le RdRp genes, ona e sili atu le ma'ale'ale o kenera e lua, ma fa'aitiitia ai fa'aletonu sese12.O se su'esu'ega i Vienna, Ausetalia na fa'aalia ai fo'i o voluma fa'ata'ita'iga lapopo'a ma fa'amauina voluma eluent na fa'aitiitia ai a'afiaga fa'afefeteina ma fa'ateleina le fa'aogaina lelei13.O le mea lea, o le fetaui lelei a Abbott mo le suʻega a le SARS-CoV-2 e mafai ona fesoʻotaʻi ma se faiga e suʻesuʻeina faʻavae e suʻesuʻe i le taimi lava e tasi genes tuʻufaʻatasia, aveese mai se numera tele o faʻataʻitaʻiga (0.5 ml), ma faʻaaogaina le tele o le eluent (40 µl).
O a matou faʻaiʻuga na faʻaalia ai foi o le suʻesuʻeina o le suʻega a le Daan e toetoe lava tutusa ma le CRS.O lo'o ogatasi lea ma se su'esu'ega14 na faia i le Iunivesite o Anhui i Huainan, Saina, ma le fa'ai'uga a le gaosi oloa e 100% lelei le maliliega.E ui i lipoti o faʻaiʻuga faifai pea, e tasi le faʻataʻitaʻiga na sese le lelei ina ua uma ona toe suʻeina le luate lava e tasi, ae na lelei i suʻega a Abbott SARS-CoV-2 ma Sansure Biotech nCoV-2019.E ta'u mai ai e ono iai le fesuisuia'i o fa'ai'uga i ituaiga eseese o su'ega. Ae ui i lea, i le suʻesuʻega na faia i Saina15, o le taunuuga o le Daan Gene assay na matua ese lava (p <0.05) faʻatusatusa i la latou suʻesuʻega faʻamatalaga faʻamaonia. Ae ui i lea, i le suʻesuʻega na faia i Saina15, o le taunuuga o le Daan Gene assay na matua ese lava (p <0.05) faʻatusatusa i la latou suʻesuʻega faʻamatalaga faʻamaonia. Тем не менее, в исследовании, проведенном в Китае15, результат анализа Daan Gene значительно отличался (p <0.05) гланотлон Ae ui i lea, i se suʻesuʻega i Saina15, o le suʻesuʻega a Daan Gene e matua ese lava (p <0.05) mai a latou suʻesuʻega faʻamatalaga suʻesuʻe.然而，在中国进行的研究中15，大安基因检测的结果与其实验室定义的参考定义的参考检测看0.然而，在中国进行的研究中15，大安基因检测的结果与其实验室定义的参考定义的参考检测看0. Однако в исследовании, проведенном в Китае15, результаты генетического теста Daan значительно отличались (p) < 0,05 Ae ui i lea, i se suʻesuʻega i Saina15, o faʻaiʻuga o le suʻega faʻapitoa a Daan e matua ese lava (p <0.05) faʻatusatusa i lana suʻega suʻesuʻe suʻesuʻe.O lenei eseesega e ono mafua ona o le maaleale o le suʻega faʻasino e iloa ai le SARS-CoV-2, ma nisi suʻesuʻega e ono taua e iloa ai le mafuaʻaga.
E le gata i lea, o la matou suʻesuʻega na suʻesuʻeina le faʻatusatusaga o le faʻataʻitaʻiga o le SARS-CoV-2 BGI faʻatasi ma le CRS, o loʻo faʻaalia ai le lelei o le pasene malie (PPA = 97.9%), le lelei pasene maliliega (NPA = 100%), ma le aofaʻi o pasene maliliega i itupa ( OPA).).= 98.8%).O tau a Cohen's Kappa na faʻaalia le maliliega lelei (K = 0.975).O suʻesuʻega i Netherlands16 ma Saina15 na faʻaalia ai taunuuga tumau.Ole su'ega SARS-CoV-2 BGI ole su'ega su'esu'e e tasi (ORF1a/b) e fa'aaoga ai le 10 µl amplification/deteksi eluate.E ui ina lelei le maliliega fa'afuainumera ma a tatou fa'amatalaga fa'amatalaga, o le au'ili'iliga na misia ni fa'ata'ita'iga lelei se lua (1.22%) o le aofa'i o fa'ata'ita'iga.E mafai ona i ai le tele o a'afiaga fa'afoma'i mo felauaiga fa'agaioiga i le ma'i ma fa'alapotopotoga.
O le isi su'esu'ega fa'atusatusa na aofia i lenei su'esu'ega o le su'esu'ega a le Sansure Biotech nCoV-2019 rRT-PCR (RUO);o le aofa'i o pasene fetaui e 96.3%.O le malosi o le maliliega na fuafuaina foi e le Cohen's Kappa tau, lea e 0.925, e faʻaalia ai le maliliega atoatoa ma le CRS.Toe foi, o matou taunuuga e tutusa ma suʻesuʻega na faia i le Central South University i Changsha, Saina, ma i le Clinical Laboratory Department a Liuzhou People's Hospital, Liuzhou City, China17. E ui lava na fa'amauina le fa'amaumauga lelei o lo'o i luga, o le su'ega chi-square (su'ega MacNemar) na fa'aalia ai o le fa'ai'uga o le su'esu'ega a le Sansure Biotech na i ai se eseesega tele fa'atusatusa i le CRS (p <0.005). E ui lava na fa'amauina le fa'amaumauga lelei o lo'o i luga, o le su'ega chi-square (su'ega MacNemar) na fa'aalia ai o le fa'ai'uga o le su'esu'ega a le Sansure Biotech na i ai se eseesega tele fa'atusatusa i le CRS (p <0.005). Несмотря на то, что было зафиксировано указанное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий Макнемара) показал, что результат анализа Sansure Biotech имеет статистически значимое различие по сравнению с CRS (p < 0,005). E ui lava o le maliega faʻafuainumera lelei o loʻo i luga na faʻamauina, o le chi-square test (McNemar test) na faʻaalia ai o le taunuuga o le Sansure Biotech assay na i ai se eseesega taua faʻatusatusa i le CRS (p <0.005).尽管记录了上述良好的统计一致性，但卡方检验（MacNemar 检验）表明，Sansure Biotech 检测的结果与CRS 相比具有统计学显着差异（p < 0.005）。尽管 记录 了 了 了 了 良好 良好 统计 性 性 性 性 性 性......）））） Несмотря на отмеченное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий Макнемара) показал статистически значимую разницу (p < 0,005) между анализом Sansure Biotech и CRS. E ui lava i le maliega faʻafuainumera lelei o loʻo taʻua i luga, o le chi-square test (McNemar test) na faʻaalia ai se eseesega taua (p <0.005) i le va o le Sansure Biotech assay ma le CRS.E ono faʻataʻitaʻiga (3.66%) na maua o ni faʻamatalaga sese pe a faʻatusatusa i le CRS (Tulafono Faʻaopoopo 1);e taua tele lenei mea, aemaise lava ona o le malosi o le faʻasalalauina o le siama.O fa'amaumauga o lo'o i luga o lo'o lagolagoina ai fo'i lenei fua faatatau maualalo15.
I lenei suʻesuʻega, na faʻamautu ai Ct tau mo suʻega taʻitasi ma faʻavae taʻitasi, faʻatasi ai ma le tau maualalo maualalo Ct na lipotia i le Abbott SARS-CoV-2 suʻega.O lenei fa'ai'uga e ono feso'ota'i ma le faiga fa'ata'ita'iga tu'ufa'atasi tu'ufa'atasi a Abbott mo le su'esu'eina o le SARS-CoV-2.O le mea lea, e tusa ai ma le Ata 1, 87.6% o Abbott SARS-CoV-2 iʻuga na maua Ct tau i lalo ifo o le 20. Naʻo se numera laʻititi o faʻataʻitaʻiga faʻaiʻuga (12.4%) sa i le 20-30 laina.Ct tau i luga atu o le 30 e leʻi faʻamauina.I le faʻaopoopoga i le faʻaogaina e Abbott o le SARS-CoV-2 panel genetic testing format, o lenei taunuuga e ono fesoʻotaʻi ma le tapulaa maualalo (32.5 RNA kopi / mL) 18, lea e faatolu ona maualalo nai lo le tapulaa maualalo a le kamupani o le 100 kopi RNA. /mL.ml)19.
O lenei suʻesuʻega e iai ni tapulaʻa: muamua, e leai ni a matou metotia masani / faʻamatalaga [pei o viral load poʻo isi suʻega suʻesuʻe (LDA)] ona o le le lava o punaoa.Lona lua, o faʻataʻitaʻiga uma na faʻaaogaina i lenei suʻesuʻega o nasopharyngeal swabs, ae o taunuuga e le faʻatatau i isi ituaiga faʻataʻitaʻiga, ma lona tolu, o la matou faʻataʻitaʻiga e laʻititi.
O lenei suʻesuʻega faʻatusatusa le faʻatinoga o suʻega rRT-PCR e fa mo le SARS-CoV-2 faʻaaogaina faʻataʻitaʻiga nasopharyngeal.O su'ega su'esu'e uma e toetoe lava a fa'atusa fa'atinoga, se'i vaganā ai le su'ega a le Sansure Biotech. E le gata i lea, o le maualalo o le positivity rate na iloa i le Sansure Biotech assay faʻatusatusa i le CRS (p <0.05). E le gata i lea, o le maualalo o le positivity rate na iloa i le Sansure Biotech assay faʻatusatusa i le CRS (p <0.05). Кроме того, в тесте Sansure Biotech был выявлен низкий процент положительных результатов по сравнению с CRS (p <0,05). E le gata i lea, o le suʻega a le Sansure Biotech na faʻaalia ai se pasene maualalo o taunuuga lelei faʻatusatusa i le CRS (p <0.05).此外，与CRS 相比，Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p <0.05).此外，与CRS 相比，Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p <0.05). Кроме того, анализ Sansure Biotech имел более низкий уровень положительных результатов по сравнению с CRS (p <0,05). E le gata i lea, o le suʻega a le Sansure Biotech e maualalo le fua faʻatatau ile CRS (p <0.05).O le su'esu'ega a le Sansure Biotech nCoV-2019 (RUO) o le PPA, NPA ma le maliega atoa na sili atu i le 93.5% ma le Cohen Kappa malosi o maliega e 0.925.Ma le mea mulimuli, e manaʻomia e le Sansure Biotech Assay (RUO) se faʻamaoniga atili mo le faʻaaogaina i Etiopia, ma suʻesuʻega faaopoopo e tatau ona mafaufauina e iloilo ai tagi mai tagata taʻitoʻatasi.
O suʻesuʻega faʻatusatusa na faia i nofoaga faʻalesoifua maloloina e fa i Addis Ababa, Eka Kotebe Hospital, Millennium Church Treatment Centre, Zewooditu Memorial Hospital, ma St. Peter's Tuberculosis Specialist Hospital.O faʻamaumauga na aoina i le va o Tesema 1 ma le 31, 2020. O falemaʻi mo lenei suʻesuʻega na filifilia ma le faʻamoemoe e faʻatatau i le maualuga o latou numera o mataupu ma le maua o nofoaga autu mo togafitiga i totonu o le taulaga.I se tulaga talitutusa, o meafaifaʻaili, e aofia ai le ABI 7500 ma Abbott m2000 meafaifaʻaili PCR taimi moni, na filifilia e tusa ai ma fautuaga a le NAAT reagent gaosi oloa, ma e fa PCR detection kits na filifilia mo lenei suʻesuʻega, ona o le tele o fale suʻesuʻe i Etiopia na faʻaaogaina a itiiti ifo. e toafa i latou.Su'ega kene, su'ega a Abbott SARS-CoV-2, su'ega Sansure Biotech, ma su'ega BGI SARS-CoV-2 na faia i le taimi o le su'esu'ega).
O suʻega mo le SARS-CoV-2 na faia mai le 1 i le 30 Tesema 2020 e faʻaaoga ai le 3 ml o Viral Transport Medium (VTM) (Miraclean Technology, Shenzhen, Saina) mai tagata taʻitoʻatasi o loʻo suʻesuʻeina mo le COVID-19 o loʻo taʻua i le EPHI.O faʻataʻitaʻiga o le nasopharyngeal na aoina e tagata aoina faʻataʻitaʻiga ua aʻoaʻoina ma auina atu i le EPHI i faʻailoga tolu.A'o le'i tu'uesea le nucleic acid, e tu'uina atu i fa'ata'ita'iga ta'itasi se numera fa'ailoa tulaga ese.O le fa'aaogaina e fa'atino mai fa'ata'ita'iga ta'itasi i le taimi lava e taunu'u mai ai e fa'aaoga ai le fa'aaogaina o le tusi lesona ma auala otometi.O le mea lea, mo le faʻapipiʻiina otometi o Abbott m2000, 1.3 ml (e aofia ai le 0.8 ml voluma oti ma le 0.5 ml faʻapipiʻiina le voluma) o le faʻataʻitaʻiga na maua mai faʻataʻitaʻiga taʻitasi ma pasia le Abbott DNA Sample Preparation System (Abbott Molecular Inc. des Plaines, IL, ISA).) O se vaega o le 96 [92 faʻataʻitaʻiga, lua faʻataʻitaʻiga faʻataʻitaʻiga ma lua e le o faʻataʻitaʻiga faʻataʻitaʻiga (NTC)] na aofia i le faagasologa atoa (toe maua ma suʻesuʻeina) o taamilosaga e lua o le SARS-CoV-2 (EUA) i le taimi moni.maina.E fa'apena fo'i, mo le fa'aaogaina o le tusi lesona, fa'aoga tutusa fa'ata'ita'iga (mo le fa'atosina otometi ma maua).O le mea lea, i le faagasologa atoa, 140 μl faʻataʻitaʻiga na vaʻaia ma aveese mai e faʻaaoga ai le QIAamp Viral RNA Mini Kit (QIAGEN GmbH, Hilden, Siamani) i vaega o le 24 (e aofia ai faʻataʻitaʻiga 20, lua faʻataʻitaʻiga faʻataʻitaʻiga ma lua NTC) i luga o le iva taamilosaga.O luate na aumai limalima na faʻateleina ma maua i le faʻaaogaina o le ABI 7500 thermal cycler faʻaaogaina le SARS-CoV-2 BGI suʻega, Daan Gene suʻega, ma le Sansure Biotech suʻega.
Otometi fa'aesea ma fa'amamāina o le SARS-CoV-2 viral RNA o lo'o mulimulita'i i le fa'avae maneta lopa e fa'aaoga ai le Abbott DNA fa'ata'ita'iga sauniuni fa'ata'ita'iga.O le faʻaaogaina o faʻataʻitaʻiga ma le solubilization o vaega viral o loʻo faʻatinoina e faʻaaoga ai se vailaʻau o loʻo i ai le isothiocyanate guanidine e faʻaumatia ai le polotini ma faʻagata ai le RNase.Ona tuueseeseina lea o le RNA mai le polotini e ala i le tuueseeseina o vaega mautu e faaaoga ai le silica, e pei o le masima guanidinium ma le pH alkaline o le lysis buffer e siitia ai le fusifusia o le nucleic acids i le silica (SiO2).O le la'asaga fufulu e aveese ai polotini o totoe ma otaota ina ia maua ai se vaifofo manino.O le RNA manino o lo'o tu'u'ese'ese mai le silica-based microparticles e fa'aaoga ai le maneta o le meafaigaluega20,21.I le isi itu, o le tu'uesea ma le fa'amamāina o le RNA o lo'o fa'atinoina e ala i le fa'aogaina o le koluma e fa'aogaina ai le centrifugation nai lo le tu'u maneta ma le vavaeeseina o microparticles mai le eluent.
O le Abbott Real-Time SARS-CoV-2 Detection Test (Abbott Molecular, Inc.) na faia e tusa ai ma faʻatonuga a le gaosiga, lea na maua EUA19,22 mai le WHO ma le FDA.I lenei faʻasalalauga, faʻataʻitaʻiga le faʻaaogaina aʻo leʻi faʻaaogaina na faia i totonu o le vai taele i le 56 °C mo le 30 min.Ina ua uma le inactivation o le siama, sa faia le su'eina o le nucleic acid i luga o se meafaigaluega Abbott m2000 SP mai le 0.5 ml VTM e fa'aaoga ai le Abbott m2000 DNA sample preparation system.e tusa ai ma le gaosiga.O le faʻalauteleina ma le suʻesuʻeina na faia i le faʻaaogaina o se meafaigaluega a Abbott m2000 RT-PCR, ma na faʻatinoina le lua suʻesuʻega mo genes RdRp ma N.ROX) ma le VIC P (valu fa'apitoa) mo le fa'atatauina ma le su'esu'eina o fa'atonuga i totonu, fa'atagaina le su'esu'eina tutusa o oloa fa'aopoopo e lua 19 .
O le fa'alauteleina o le fa'aogaina o lenei pusa e fa'avae i luga ole la'asaga tasi RT-PCR tekonolosi.O le ORF1a/b ma le N genes na filifilia e fai ma itulagi fa'asao e Daan Gene Technology e iloa ai le fa'alauteleina o le itulagi.O su'esu'ega fa'apitoa ma su'esu'ega fa'amalama (N gene su'esu'e fa'ailogaina FAM, ORF1a/b su'esu'e fa'ailoga VIC) ua mamanuina e iloa ai le SARS-CoV-2 RNA i fa'ata'ita'iga.Na saunia le fa'afefiloi mulimuli ma le fa'afefiloi matai e ala i le fa'aopoopoina o le 5 µl o le eluent i le 20 µl o le fa'afefiloi matai i se voluma mulimuli e 25 µl.O le fa'alauteleina ma le su'esu'eina sa faia i le taimi e tasi i luga ole meafaifa'aili PCR ole ABI 750024.
O le ORF1a/b ma le N genes na maua i le fa'aaogaina o le Sansure Biotech nCoV-2019 Nucleic Acid Diagnostic Kit (fluorescent PCR detection).Sauni su'esu'ega fa'apitoa mo kene ta'itasi e ala ile filifilia ole ala FAM mo le itulagi ORF1a/b ma le ala ROX mo le gene N.I lenei pusa su'esu'e, ua fa'aopoopo i ai mea fa'afefiloi fa'afefiloi e fa'apea: saunia le 30 μl fa'afefiloi fa'afefiloi ma le 20 μl fa'ata'ita'iga fa'afefiloi mo le su'esu'eina/fa'ateleina.O le taimi moni PCR ABI 750025 na faʻaaogaina mo le faʻalauteleina / suʻesuʻeina.
O le su'ega SARS-CoV-2 BGI o se pusa fa'amalama rRT-PCR mo le su'esu'eina ole COVID-19.O le itulagi fa'amoemoe o lo'o i totonu o le ORF1a/b itulagi o le SARS-CoV-2 genome, o se auala e tasi e su'e ai kenera.E le gata i lea, o le gene β-actin o loʻo faʻatonutonuina i totonu o le fale.O le master mix e saunia e ala i le faʻafefiloi o le 20 µl o le master mix reagent ma le 10 µl o le RNA faʻataʻitaʻiga na aumai i totonu o se ipu vaieli26.O le ABI 7500 fluorescent quantitative real-time PCR instrument na faʻaaogaina mo le faʻalauteleina ma le iloa.O fa'aopoopoga uma ole nucleic acid, tulaga ole PCR mo su'ega ta'itasi, ma le fa'auigaina o fa'ai'uga na fa'atinoina e tusa ai ma fa'atonuga a le kamupani gaosi oloa (Tula'au 3).
I lenei fa'atusatusaga o su'esu'ega, matou te le'i fa'aogaina le fa'ata'ita'iga fa'ata'ita'iga e fuafua ai le pasene maliliega (lelei, leaga, ma le aotelega) ma isi fa'atusatusaga fa'atusatusaga mo su'esu'ega e fa.O faʻatusatusaga faʻataʻitaʻiga taʻitasi na faia ma le CRS, i lenei suʻesuʻega o le CRS na faʻatulagaina e le tulafono "soʻo se mea lelei" ma o le taunuuga na faʻamoemoeina, ae le o se suʻega se tasi, matou te faʻaaogaina a itiiti ifo ma le lua suʻega suʻega tutusa.E le gata i lea, i le tulaga o faʻasalalauga COVID-19, o faʻaiʻuga leaga sese e sili atu ona mataʻutia nai lo faʻaiʻuga lelei sese.O le mea lea, ina ia ta'ua le "lelei" i le sa'o sa'o mai se fa'ai'uga CRS, ia le itiiti ifo ma le lua su'ega su'ega e tatau ona lelei, o lona uiga e le itiiti ifo ma le tasi le fa'ai'uga lelei e ono maua mai le su'ega a le EUA.O lea la, mai fa'ai'uga o su'ega, lua pe sili atu fa'ai'uga o su'ega e maua ai le fa'ai'uga tutusa e manatu i ai e moni lelei pe leaga18,27.
Na aoina faʻamaumauga e faʻaaoga ai fomu faʻapipiʻiina o faʻamaumauga, faʻamaumauga faʻamaumauga ma auʻiliʻiliga na faʻatinoina e faʻaaoga ai le Excel numera software ma le SPSS version 23.0 mo faʻamatalaga faʻamaumauga.Sa su'esu'eina lelei, leaga, ma le aofa'i o le pasene maliliega, ma sa fa'aogaina le sikoa Kappa e iloa ai le tikeri o le maliliega o metotia ta'itasi ma le CRS.O tau o Kappa o loʻo faʻamatalaina e faapea: 0.01 i le 0.20 mo maliega malie, 0.21 i le 0.40 mo maliega lautele, 0.41-0.60 mo maliega feololo, 0.61-0.80 mo maliega tetele ma le 0.81-0.99 mo maliega atoatoa28.
Na maua le kiliaga fa'apitoa mai le Iunivesite o Addis Ababa ma fa'ata'ita'iga uma mo lenei su'esu'ega na fa'amaonia e le Ethiopian Public Health Institute's Scientific Ethics Review Board.Ole numera fa'asino mo le EPHI Ethics License o le EPHI/IRB-279-2020.O metotia uma na faʻaaogaina e tusa ai ma fautuaga ma aiaiga a le Etiopian National Comprehensive Guidelines mo le Togafitiga o le COVID-19.E le gata i lea, na maua mai le maliega tusitusia mai tagata suʻesuʻe uma aʻo leʻi auai i le suʻesuʻega.
O faʻamaumauga uma na maua pe suʻesuʻeina i lenei suʻesuʻega o loʻo aofia i lenei tusiga faʻasalalau.O fa'amaumauga e lagolagoina ai fa'ai'uga o lenei su'esu'ega e maua mai le tusitala ta'itasi pe a fa'atatau i talosaga.
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Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI COVID-19 su'esu'ega atamai i le Matagaluega o Faalavelave Tutupu Faafuasei: Fa'ata'ita'iga uma. Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI COVID-19 su'esu'ega atamai i le Matagaluega o Faalavelave Tutupu Faafuasei: Fa'ata'ita'iga uma.Muliou, DS, Pantazopoulos, I. ma Gurgulianis, KI Su'esu'ega atamai ole COVID-19 ile matagaluega o fa'alavelave fa'afuase'i: mea uma ile fa'atinoga.Muliou DS, Pantazopoulos I. ma Gurgulyanis KI Su'esu'ega atamai ole COVID-19 ile matagaluega o fa'alavelave fa'afuase'i: tu'ufa'atasia i le fa'atinoga.Fa'apitoa Reverend Respire.vaila'au.3, 263–272 (2022).
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Taimi meli: Tes-08-2022